2021双十一MD工作站配置推荐

今晚8点双十一活动就开始了，这里推荐两套用于MD模拟的工作站配置，其中1号配置几乎是目前跑大体系MD模拟任务和量化任务最快的消费级平台。（线程撕裂者是准专业级，排除了）
配置单里写的购买渠道都是非常稳妥的，开发票非常方便，完全适用于公费采购。如果是个人购买，在有售后保障的前提下可以去更便宜的渠道，CPU可以买散片。

配置单中两张显卡都需要抢，按以往规律，今晚大概率是秒无，但之后一段时间又会时不时有货几秒，有耐心的同志可以花点时间疯狂刷新，找到机会立刻下单，鄙人之前就是用这种办法抢到了许多许多耍猴产品，包括但不限于Nvidia显卡、小米平板触控笔。如果实在抢不到，可以找找JD自营的其他品牌，看有没有价格合适的非丐卡，也可以去桃饱买，价格和JD自营相差不大，但不含税，要开票得加税点。需要注意的是，如果去桃饱买显卡，也请尽量选择配置单中推荐的，再不济也要选个人送保方便的品牌，例如七彩虹、影驰、铭瑄。

AMD Ryzen平台相较于intel Core平台有一个优势——支持ECC-UDIMM内存，所以这里只推荐AMD Ryzen CPU。需要注意：Ryzen APU不支持ECC内存，另外有一些主板也不支持ECC内存，这里推荐的都是华擎主板，因为华擎X570主板全系支持ECC内存。

1号配置中主板和显卡都选了用料很扎实的旗舰/次旗舰产品，主要是考虑到平台功耗高、发热大，长期满载的情况下丐版用料容易出问题。不建议自行改为丐版显卡和主板。1号配置的SSD选了当前性价比最高的PCIe4.0 SSD，浦科特M10P，这块硬盘综合性能比三星980Pro和西部数据SN850都强，在消费级产品中仅次于奇贵无比的希捷酷玩530。浦科特一直以来都采用东芝原厂NAND闪存颗粒，产品性价比也都很不错，但由于其不善营销，故在大众市场不知名。

内存和机械硬盘的购买渠道只标了桃饱，具体什么店铺就不说了，免得有广告嫌疑，诸位自己去找开店时间久、评价靠谱的店铺就行。机械硬盘要认准有西部数据零售代理资格的店铺。

散热器和机箱风扇都推荐了利民的高端产品，FC140和TL-C14X在B站上都有评测，性能都是顶级，性价比也非常高。先马朱雀机箱出厂预装了前面板的3把风扇，上侧和后侧一共3个14cm风扇位，2号配置中只给了1把14cm风扇，应该装到后侧。如果觉得机箱风扇一百多元一把买不起，也可以另找便宜的工业扇，缺点就是噪音奇大。

1号配置在Ubuntu 20.04环境使用Gromacs 2020.6跑20万原子体系，rvdw=1.4的情况下，速度是XEON W-2145 & RTX 2060的3倍、XEON Gold 5220 & RTX 2060的2.5倍；2号配置分别为2倍、1.8倍。

Gromacs在使用GPU加速的情况下，对CPU性能仍有一定要求，特别是在使用浮点性能非常强的Ampere架构中高端GPU的情况下，对CPU要求很高。1号配置使用了Zen3架构16核心全核满载4.5GHz的5950X，但在跑100万原子的巨大体系时仍然显示出明显的CPU瓶颈，对于小几十万原子的体系，CPU瓶颈不太明显，mdrun时设置-nt 32即可。

如果你使用的是Amber、NAMD v3等在调用GPU加速后对CPU需求不高的MD程序，同时预算很吃紧，也可以把CPU降为5800X，其中1号配置的主板和内存改成和2号一样的。预算不吃紧就不用降了，CPU性能强不会吃亏，可以用来跑跑量化，毕竟做MD研究的过程中多少会涉及一些量化任务。超频Tips: 配置单中的2张显卡都可以按下挡板上的“一键超频”按钮来拉升频率和功耗墙，是原厂调好的方案，很稳定，建议日常按下；AMD Ryzen CPU的平台，应该去主板BIOS打开PBO选项，性能有大幅提升，也很稳定。进阶的超频，玩玩就好，不建议日常使用，除非你能确认核心体质非常好。