基于自己开发的服务器搭建的这套GPU集群已经在自己课题组里上线运行了一段时间（硬件如p4~9所示），跨节点并行计算性能完全符合预期，同时很稳定，至今从未出现过“掉卡”问题，比一些基于“大厂准系统”的8卡4090机器稳定多了。 目前只上了3个计算节点，24块V100 SXM2 16GB，还不是“完全体”，主要原因是机房capacity不足（白嫖机房还要啥自行车），等几个月后学校的新机房建成，也许有机会进一步扩展。 “完全体”有3种规模，架构分别如p1~3所示。其中p2的144- […]
Computex 2024上intel公布了Xeon 6的一系列SKU，分LGA-4710和LGA-7529两种Socket，对应6700系列和6900系列，命名有很大变化，不过命名在技术上并不重要，重要的是Xeon 6900P分支（Granite Rapids-AP, GNR-AP）的Top SKU有希望追上AMD EPYC Turin Classic。 Xeon GNR-AP的内核微架构是Redwood Cove，与Meteor Lake P-core的Redwood C […]
作为科学计算研究人员，站在HPC/科学计算的角度评论一下昨天发布的Blackwell GPU。 1. 完全没提到Vector算力，包括FP32 Vector和FP64 Vector。而这两者是HPC最主要使用的算力，由所谓的CUDA Core提供。FP64 Tensor算力相较于上代H100也倒退了，64TFLOPS>40TFLOPS，另外，作为对比，AMD Instinct MI300X的FP64 Matrix是163TFLOPS。NVIDIA放弃HPC是意料之中的 […]
经历7个月研究+19个月打磨，人生第一篇几乎100%自主完成的学术论文终于online了（之前高中时写着玩的那篇核心不算）：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432 打磨这么久主要是因为本科阶段与科研无关的事情太多+后期“移情别恋”了。 接下来简单讲讲和这篇研究工作相关的经历吧（⚠流水账预警⚠）。 参加GMX培训班之前，我对MD了解并不多，只会用packmol搓模型+用GMX跑一些最简单的MD。2021年初，牙 […]
——关于“跑经典MD的计算机到底选什么配置”的终极讨论 [本文首发于计算化学公社 | 文 熵增焓减 | yult-entropy@qq.com | 2023-03] 0 写在前面 为防止太早过时，本文不会给出具体的配置单，然而本文所写的方案框架也只是基于近期硬件行情得出的，半年到一年后本文所写的方案依然可能过时，故此类内容会不定期更新，欢迎持续关注。 1 GMX GMX机子的配置方案是最复杂、最值得仔细考虑的，GMX中的GPU加速在去年10月的文章中已经有所介绍，且GMX […]
秃头咪蒙锐评的后半段太赞同了。 新时代的教育早已不是一套教科书所能决定的，把大量资源浪费在初级知识和无意义的应试中，非常不合理。教材所展示出的出版社与审查相关问题固然值得重视，但也应该找到一种更高效的教育制度。在2018年底写的论文中我就曾从高中化学教育角度讨论过——高中生对化学误解的成因分析及纠错建议，总觉经典，常看常新。 作为底层农民（后来有了个体户）家庭出生的我对秃头咪蒙所言体会颇深。高中以前几乎完全不能在课本上学到前沿科学的知识，但幸好家庭条件差，奶头乐接触得少，加上 […]
这学期的《材料科学基础》课程考核要求每人讲述一个与材料科学相关的故事，今日轮到我，遂将口述原文记录于此，附PPT图片。 P1 （封面页） P2 先看个科普视频。 P3 在芯片制造领域，有一个非常经典的“摩尔定律”，它说“集成电路芯片上所集成晶体管的密度，每隔18个月就翻一倍”。首先，这个“摩尔定律”并不是一个物理定律，而是上世纪60年代intel创始人之一——戈登·摩尔根据经验提出的一个预测。 半导体芯片发展了这么多年，早期确实是按照这个所谓摩尔定律在稳步 […]
