Aug-2023 by ア熵增焓减ウ | yult-entropy@qq.com | entropylt@163.com 打击黄狗，人人有责 0 前言 近两年，全球有大量顶级超级计算机采用了AMD GPU作为异构加速器，因此大量HPC应用程序开始了移植到ROCm软件栈的进程，并且其中很大一部分已经具有很高的完成度和很好的性能，可以用于正式的科学研究。此外，也有一部分程序原生支持了intel GPU。鉴于此，笔者集齐了所有NVIDIA Ada Lovelace架构桌面GPU、 […]
[本文首发于计算化学公社 | 文 熵增焓减 | yult-entropy@qq.com | 2023-03] 0 写在前面 近期intel W790平台的系列产品即将或已经上市，笔者对其中2个具有代表性的型号进行了性能测试，分别是intel Xeon w7-2495X和intel Xeon w9-3495X。 本文MD测试部分只包括GROMACS 2023，其中所用模型与此系列首篇完全一致；另增加了Gaussian 16 Rev. C.02 AVX2和ORCA 5.0.4这 […]
[本文首发于计算化学公社 | 文 熵增焓减 | yult-entropy@qq.com | 2023-03] 0 写在前面 去年10月的文章中说： “如今Ada Lovelace架构刚刚上市，并无针对性优化，预计在将来几个月，随着几款MD软件以及编译器和驱动层面对于Ada Lovelace架构的优化，RTX 4090运行MD模拟的性能还会有进一步提升。” 如今已过去5个月，是时候检验一下自己是否被打脸了。 1 测试平台 硬件： ID CPU GPU 内存-RAM 主板-Mot […]
前两天发了《性能翻倍？RTX4090科学计算之经典MD模拟全面测试》，简单提了一下硬件采购方面的建议，但没有写具体的配置。 今天发现近期有朋友在我去年发的《2021双十一MD工作站配置推荐》底下提到希望推荐一下今年的配置，于是看了一下行情，发现大量配件缺货（似乎老黄清完3070、3080Ti、3090的库存了…？），连CPU都有缺货情况，所以一开始是决定不推荐今年的版本，不过后来想到之前公社群聊里有一些朋友也在说买不起4090、想装一套便宜点的MD机器，所以我又仔细看了一圈， […]
[本文首发于计算化学公社 | 文 熵增焓减 | 赞助 51972, 庚子计算 | yult-entropy@qq.com | 2022-10] 0 写在前面 这次测试最初的目的是证明用何种性能级别的CPU可在运行GPU加速GROMACS（简称GMX）时榨干最新顶级消费级GPU——NVIDIA GeForce RTX 4090，但某日笔者建议一些bilibili UP主测试该GPU运行“生产力”软件的发言被不学无术/不懂装懂者群起而攻之，遂决定亲自上阵，在最初的测试计划中引入一 […]
写在前面 今日见B站UP主远古时代装机猿向广大高校师生征集各专业的计算机配置推荐，遂提交了一份我的想法，先贴在此，待相应的视频发布后我再将此文公开罢。 投稿正文 面向人群：化学专业本、硕、博在读或即将入学者。 特别备注：1. 本篇推荐不考虑电子游戏需求；2. 完全不推荐Apple Mac。 除计算化学方向以外，均建议选择无独立显卡的轻薄全能笔记本。化学专业（除计算化学方向以外）用到的大部分软件对各种平台兼容性都很好。预算充足的情况下，CPU选择6800H、12 […]
今晚8点双十一活动就开始了，这里推荐两套用于MD模拟的工作站配置，其中1号配置几乎是目前跑大体系MD模拟任务和量化任务最快的消费级平台。（线程撕裂者是准专业级，排除了）配置单里写的购买渠道都是非常稳妥的，开发票非常方便，完全适用于公费采购。如果是个人购买，在有售后保障的前提下可以去更便宜的渠道，CPU可以买散片。 配置单中两张显卡都需要抢，按以往规律，今晚大概率是秒无，但之后一段时间又会时不时有货几秒，有耐心的同志可以花点时间疯狂刷新，找到机会立刻下单，鄙人之前就是用这种办法 […]
