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写在前面 今日见B站UP主远古时代装机猿向广大高校师生征集各专业的计算机配置推荐，遂提交了一份我的想法，先贴在此，待相应的视频发布后我再将此文公开罢。 投稿正文 面向人群：化学专业本、硕、博在读或即将入学者。 特别备注：1. 本篇推荐不考虑电子游戏需求；2. 完全不推荐Apple Mac。 除计算化学方向以外，均建议选择无独立显卡的轻薄全能笔记本。化学专业（除计算化学方向以外）用到的大部分软件对各种平台兼容性都很好。预算充足的情况下，CPU选择6800H、12 […]
秃头咪蒙锐评的后半段太赞同了。 新时代的教育早已不是一套教科书所能决定的，把大量资源浪费在初级知识和无意义的应试中，非常不合理。教材所展示出的出版社与审查相关问题固然值得重视，但也应该找到一种更高效的教育制度。在2018年底写的论文中我就曾从高中化学教育角度讨论过——高中生对化学误解的成因分析及纠错建议，总觉经典，常看常新。 作为底层农民（后来有了个体户）家庭出生的我对秃头咪蒙所言体会颇深。高中以前几乎完全不能在课本上学到前沿科学的知识，但幸好家庭条件差，奶头乐接触得少，加上 […]
本月初，应某超算平台邀请，为其GPU节点运行GMX的性能做了一点Benchmark，在这里跟uu萌分享捏（其实是邀请的是我老师，她把这活转给我干乐） 对于GMX用户嘛，总结起来就一句话：别去用没有NVLink且CPU很弱的GPU集群（什么废话x 附上测试的原始数据： 本文同步发表于计算化学公社论坛
刚刚给组里申请到Amber 20学术License，就顺便把4月份的坑给填上罢😨 开始前先将AmberTools21.tar.bz2和Amber20.tar.bz2解压至工作站/服务器目录/opt 0 安装依赖 sudo apt update && apt -y install tcsh make gcc gfortran flex bison patch bc xorg-dev libbz2-dev wget python-is-python3 pytho […]
今晚8点双十一活动就开始了，这里推荐两套用于MD模拟的工作站配置，其中1号配置几乎是目前跑大体系MD模拟任务和量化任务最快的消费级平台。（线程撕裂者是准专业级，排除了）配置单里写的购买渠道都是非常稳妥的，开发票非常方便，完全适用于公费采购。如果是个人购买，在有售后保障的前提下可以去更便宜的渠道，CPU可以买散片。 配置单中两张显卡都需要抢，按以往规律，今晚大概率是秒无，但之后一段时间又会时不时有货几秒，有耐心的同志可以花点时间疯狂刷新，找到机会立刻下单，鄙人之前就是用这种办法 […]
这学期的《材料科学基础》课程考核要求每人讲述一个与材料科学相关的故事，今日轮到我，遂将口述原文记录于此，附PPT图片。 P1 （封面页） P2 先看个科普视频。 P3 在芯片制造领域，有一个非常经典的“摩尔定律”，它说“集成电路芯片上所集成晶体管的密度，每隔18个月就翻一倍”。首先，这个“摩尔定律”并不是一个物理定律，而是上世纪60年代intel创始人之一——戈登·摩尔根据经验提出的一个预测。 半导体芯片发展了这么多年，早期确实是按照这个所谓摩尔定律在稳步 […]
几个月前，组里来了两台DELL Precision 7920 Tower工作站，用于运行MD模拟。老师费了好大劲也没把环境配置好，遂于某天让我帮忙。1年多前（2020年1月），我曾尝试在Ubuntu 18.04 LTS上编译GROMACS、AMBER等MD程序，没有完全成功。那时对Linux几乎一窍不通，不过，经过1年多在计算机/IT领域各种方向上的折腾，感觉自己的水平已经可以对付上述工作。在拥挤的小屋子里折腾近10小时，又经过半个多月的试用，大约的确是成功了罢，遂应老师要求 […]
